Közéleti munkássága mellett Franklin a természettudományok terén is maradandót alkotott. Jelentős felfedezések fűződnek nevéhez. Sokat foglalkozott az elektromosság kérdésével, és számos olyan fogalmat vezetett be, amelyet ma is használnak a jelenségek leírásában (pozitív, negatív, vezető, áramforrás).